Il Comune di Sesto Fiorentino si articola in sei settori funzionali e sei unità organizzative autonome, ai quali si aggiunge l'Istituzione per i Servizi Culturali, Educativi e Sportivi (Sestoidee).

Direttore Generale  è il Dott. Giuseppe Amodei.

Segretario Generale: sede vacante.
Vicesegretario è la Dott.ssa Laura Monticini, dirigente del Settore Affari Generali e Risorse Professionali.