L'istituzione della prima Farmacia Comunale di Sesto Fiorentino risale al 1° gennaio 1918. Nel marzo 1993 la gestione in economia, viste le ragguardevoli dimensioni che aveva raggiunto il servizio farmaceutico e quello degli studi medici comunali fu sostituita dalla gestione tramite Azienda Farmaceutica Speciale. Dal 1° gennaio 2003 opera l'Azienda Farmacie e Servizi S.p.A.

La società è interamente controllata dal Comune di Sesto Fiorentino